UNIDAD UNIVERSITARIA DE
SECUENCIACIÓN MASIVA Y
BIOINFORMÁTICA

La Universidad Nacional Autónoma de México a través de la Coordinación de la Investigación Científica, pone a disposición de la comunidad científica pública y privada, la Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y Bioinformática (UUSMB) para el desarrollo de proyectos relacionados con las ciencias ‘omicas (Genómica y Transcriptómica principalmente). Contamos con las tecnologías y aplicaciones de secuenciación de alto rendimiento, ademas de los metodos bioinformáticos más adecuados para el análisis masivo de datos y para su interpretación.

Principalmente, trabajamos con la tecnología de Illumina que utiliza una química de secuenciación por síntesis basada en terminadores reversibles fluorescentes.  Las plataformas disponibles son el MiSeq, NextSeq500 y HiSeq 2500 que son capaces de generar hasta 15Gb, 120Gb y 1Tb, correspondientemente.

Podemos trabajar con otras tecnologias como Ion Torrent, PacBio y Oxford Nanopore, sin embargo ni la secuenciacion ni el analisis de estas plataformas es un servicio que se oferte de manera estadar. Si esta interesado en alguna de estas tecnologias, por favor contactenos.

Los servicios que la UUSMB ofrece son para diferentes aplicaciones como secuenciacion genómica de novo, re-secuenciación de genomas, análisis de transcriptomas y expresión diferencial, identificación de ARN pequeños (smallRNA), patrones de metilación sobre el DNA e interacción DNA-proteína (CHiP-seq) a escala genómica. La UUSMB está equipada con un sistema de computo de alto rendimiento (High Performance Computing) que reune mas de 300 nucleos de procesamiento y 3Tbytes de memoria RAM compartida. Contamos también con un sistema de almacenamiento en disco duro de hasta 70Tbytes. Todo nuestro sistema esta alojado en el cluster de computo del Instituto de Biotecnología.

Además del servicio de secuenciación, se brinda asesoría previa para los investigadores que requieran ayuda para seleccionar la mejor estrategia de secuenciacion y analisis que les permitan alcanzar las metas y objetivos de sus proyectos. Finalmente, brindamos capacitación via nuestros cursos, para el análisis de datos de secuenciación masiva.