Infraestructura

La Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva de DNA de la UNAM, cuenta con la
siguiente infraestructura

Equipo de Laboratorio

Cuenta con un laboratorio equipado con una unidad de secuenciación masiva Genome Analyzer II de Illumina, que tiene la capacidad de producir en cada corrida millones de secuencias de alta calidad y bajo costo. Esta unidad cuenta con un Modulo de Paired-End y una estación de Generación de Clusters. El laboratorio cuenta además con un sistema de electroforés capilar automatizada, Bioanalyzer 2100 Agilent, una cabina de bioseguridad clase II, tipo A2, SterilGARD, un termociclador, Biorad. Contamos con dos sistemas de electroforésis horizontal y uno vertical, marca Biorad. Un sistema de fotodocumentación de imágenes, UVP. Para el proceso de centrifugación, una microcentrifuga ventilada y otra refrigerada, marca Eppendorf, minicentrifugas, marca Labnet y un concentrador de vacío, Thermo Scientific Contamos también con un baño de temperatura, marca Labnet un rotador de tubos, Labnet. En cuanto a sistemas de refrigeración contamos con un congelar a -20° C y un refrigerador a 4° C, ambos Sanyo. El laboratorio tiene también un Horno de microondas.

Equipo de Computación

equipodecomputacionEn cuanto a equipo de computo se refiere, contamos con un cluster con un master y 38 nodos de calculos (164 cores en total), y 3 servidores de discos (23 Tb). El master cuenta con 2 CPUs 2 dual core AMD opteron 2214 a 2.2 Ghz Con memoria RAM de 4 Gb y disco duro SEagate de 120 Gb 35 nodos de calculo con CPUs 2 dual core AMD opteron 2214 a 2.2Ghz con 4Gb de memoria y disco Seagte de 120 Gb 3 nodos de calculo con CPUs de 2 Quad-Core AMD Opteron(tm) Processor 2354 2.2GHz, con 64 Gb de memoria y disco duro de 500 GB. 3 servidores: 1) CPU 2 Dual-Core AMD Opteron(tm) Processor 2214, 4Gb. en memoria y disco Seagate de 80 Gb (system), Raid 5 1464.8 Gb (1.4 Tb). 2) Con CPUs Intel(R) Xeon(TM) CPU 2.80GHz 2Gb de memoria y disco Seagate de 120 Gb (system), – Raid 5 1249.8 GB